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Arrêts maladie : le gouvernement muscle le contrôle, mais les TPE paient encore la note

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Explosion des arrêts maladie, contrôles renforcés, campagnes contre les abus : le gouvernement promet de reprendre la main sur un système qu’il juge à bout de souffle. Mais pour les très petites entreprises, déjà étranglées par chaque absence, ces annonces sonnent surtout comme un constat d’impuissance. Si les fraudeurs doivent être sanctionnés, encore faut-il que les TPE cessent d’en payer le prix fort.

Le gouvernement a dévoilé son plan pour « réduire l’absence au travail » et « lutter contre les comportements abusifs ». Un objectif clair : endiguer l’explosion des arrêts maladie, dont le coût a bondi de 45 % entre 2019 et 2025 pour atteindre près de 18 milliards d’euros d’indemnités journalières. Mais derrière cette mobilisation nationale, les petites entreprises s’interrogent : qui va réellement bénéficier du plan ? Et surtout, est-ce que les petites structures, déjà asphyxiées par la désorganisation et les charges, ne vont pas encore porter seules le poids de cette dérive ?

Un constat alarmant : des arrêts en hausse, une facture qui explose

Selon les chiffres du ministère de la Santé et de la CNAM, 9,1 millions d’arrêts de travail ont été indemnisés en 2024. Les arrêts de moins de huit jours représentent les trois quarts des cas, mais une part infime de la dépense publique (4 %). Ce sont surtout les arrêts longs et répétés, tirés par les troubles psychiques et musculosquelettiques, qui font exploser la facture. Et derrière cette tendance, 40 % de la hausse ne s’explique pas par des facteurs économiques ou démographiques : hausse non justifiée du recours, prescriptions trop longues, arrêts répétés… bref, un abus généralisé du système.

Pour les TPE, le constat est encore plus rude : chaque absence déstabilise la production, désorganise les plannings et pèse directement sur la trésorerie. Pas de service RH pour compenser, pas de remplacement possible. Quand un salarié s’arrête, c’est souvent le patron lui-même qui met la main à la pâte pour garantir la continuité.

Ce que le gouvernement met en place

Le plan présenté par la ministre de la Santé Stéphanie Rist et le ministre du Travail Jean-Pierre Farandou s’articule autour de trois axes principaux : prévention, contrôle, régulation.

  1. Encadrer les prescriptions abusives :
    • Dès le 1er septembre 2026, un premier arrêt ne pourra plus dépasser un mois, et le renouvellement deux mois, sauf exception médicale justifiée.
    • Les motifs d’arrêt devront être précisés sur les formulaires, et l’Assurance maladie pourra saisir le service médical pour avis en cas de prolongation suspecte.
    • Les prescriptions par téléconsultation sont désormais limitées à trois jours maximum, sauf exception.
  2. Renforcer le contrôle et la lutte contre la fraude :
    • Près de 740 000 contrôles d’assurés sont programmés pour 2026, ciblant notamment les arrêts courts et répétitifs, le nomadisme médical (plusieurs médecins consultés pour un même arrêt), et le cumul travail/arrêt.
    • En 2025, 49 millions d’euros de fraudes ont déjà été stoppées, soit une hausse de 15 %.
  3. Accompagner les entreprises :
    • Lancement d’un kit « clé en main » en ligne pour aider les employeurs à diagnostiquer les causes d’absentéisme et mobiliser les bons interlocuteurs (SPST, CARSAT, ANACT…).
    • Poursuite de l’accompagnement des entreprises à fort absentéisme (1 000 en 2025) et création d’un service de signalement simplifié en cas d’abus.
    • Une campagne nationale pour promouvoir la santé mentale au travail et encourager la prévention.

En parallèle, les pouvoirs publics assument un ton beaucoup plus direct : « L’abus d’arrêts maladie nuit gravement à notre système de santé », clament les affiches officielles. Et pour cause : en 2024, 13 000 assurés avaient obtenu des arrêts auprès de cinq médecins différents la même année !

Le regard des TPE : des mesures bienvenues… mais un terrain inégal

Oui, les patrons de TPE en ont assez des abus. Quand un salarié prend un arrêt douteux, c’est toute la boutique qui trinque. Et l’État n’a pas tort de vouloir remettre de l’ordre dans le système.
Les TPE applaudissent l’encadrement des arrêts courts en téléconsultation, devenue une véritable passoire depuis la crise sanitaire, et saluent l’idée d’un contrôle renforcé du nomadisme médical.

Mais la réalité du terrain, c’est que ces mesures touchent surtout les prescripteurs et les salariés, sans beaucoup d’effets immédiats sur les petites entreprises.
Les TPE restent les premières victimes de la désorganisation, mais les dernières servies des outils de prévention. Pas d’accès facilité aux cellules de conseil, pas de médecin du travail disponible, et souvent aucune ressource pour se saisir des programmes proposés. Quant au kit ministériel, très bien sur le papier, encore faut-il trouver le temps — et la personne — pour le remplir…

Et sur le plan financier, rien ne change : l’employeur continue de compléter le salaire pendant l’arrêt, de supporter la perte de productivité, et de jongler entre indemnisation et contraintes légales.

Ce qu’il manque vraiment : des leviers pour les petites structures

Les TPE n’ont pas besoin d’un nième plan de communication ou de charte de bonnes intentions.
Elles demandent :

  • Des contrôles plus rapides et des retours concrets quand elles signalent des abus.
  • Un allègement des obligations liées au complément employeur, au moins sur les arrêts courts et répétés.
  • Une prise en compte spécifique des microentreprises dans la gestion de l’absentéisme : une politique uniforme ne peut pas s’appliquer à des entreprises de trois salariés comme à un groupe de 500.
  • Un partenariat direct avec les caisses primaires pour identifier les comportements abusifs récurrents.

Parce que si le gouvernement veut vraiment « retrouver la maîtrise des arrêts de travail », il devra commencer par écouter ceux qui en subissent en premier les conséquences : les artisans, les commerçants, les restaurateurs, les dirigeants de TPE, ceux qui tiennent ce pays debout pendant que d’autres abusent du système.


 



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